国家自然科学基金管理流程分为申报准备、申请与立项、立项与执行和项目结题这四个阶段，具体可参考下面的表格。

1.申报准备。发布年度国家自然科学基金申报工作安排，申请人准备撰写申请书，根据单位安排做好选题论证、专家评审、申报书修改等工作。

本年度不在集中接受期受理的项目申请(如重大研究计划及国际合作项目等)，请随时留意国家自然科学基金委员会网站。

2.申请与立项。国家自然科学基金委员会发布的申报指南，申请人根据申报指南，登陆科学基金网络信息系统平台(https://grants.nsfc.gov.cn/pmpweb/login)，在线填写《国家自然科学基金申请书》并提交。单位组织三轮形式审查，审查无误后统一提交基金委，无须报送纸质申请书，待立项结果公布后，立项项目报送纸质申请书。

3.立项与执行。国家自然科学基金委员会发布立项结果，项目负责人根据立项通知要求填写计划书并提交，单位审核后提交自然基金委。项目负责人填写每年年度进展报告(在线，无需纸质版)，由单位审核后提交基金委。

4.项目结题。项目负责人根据国家自然科学基金委通知要求，在线填写结题报告、编制经费决算表，经财务处、审计处审核盖章后，由单位统一报送，审核通过后上报基金委，基金委审核通过后下达结题证明。重大、重点、知名专家等项目由基金委组织会议验收，抽查审计经费使用情况。